ניר דגן בעל תואר דוקטור לכלכלה מהאוניברסיטה העברית בירושלים. התמחותו היא תורת ההחלטות האינטראטיביות (הידועה בכינוי המטעה תורת המשחקים), ובתורה של שיווי משקל של מחירים (הידועה בכינוי המטעה שיווי משקל כללי).
הוא פרסם מספר מאמרי מחקר בכתבי עת מקצועיים בינלאומיים, ולימד באוניברסיטאות ובמכללות בספרד, בישראל, ובארצות הברית.